История отдела экологического образования началась с 15 июня 1918 года, когда  в Москве было создано первое внешкольное учреждение для детей – СТАНЦИЯ ЛЮБИТЕЛЕЙ ПРИРОДЫ. В Ярославской области первый КРУЖОК ЮНЫХ НАТУРАЛИСТОВ был образован 20 декабря 1924 года при Рыбинской средней школе имени А.В. Луначарского.

Чуть позже в Ярославле на базе многих школ появились юннатские кружки, а 3 июля 1940 года была организована Областная станция юных натуралистов.

1 мая 1941 года учащиеся школ города Ярославля получили подарок – Дворец пионеров. Две небольшие комнаты в нем получила и Областная станция юных натуралистов.

В те далекие годы сотрудники ОСЮН очень часто выезжали в школы области, оказывая необходимую помощь учителям в организации различных кружков, по мере возможности снабжали их методической литературой, семенами, даже рассадой

В 1949 году около 3000 школьников школ города Ярославля приняло участие «в закладке плодового сада на площади Челюскинцев (на Стрелке) в 1948 и 1949 годах». Этот сад, в значительно меньших размерах, как и сам уголок города, является излюбленным местом отдыха не только Ярославцев, но и гостей города

В 1951-52 учебном году во Дворце пионеров города Ярославля, в котором размещалась и ОСЮН (2 небольшие комнаты) был организован натуралистический отдел (Отдел юных натуралистов). В него входили кружки юных садоводов, растениеводов, цветоводов, кролиководов, пчеловодов, зоологов, юных натуралистов 3-4 классов. Основной базой для практической работы учащихся-юннатов был учебно-опытный участок ОСЮН. К тому времени на УОУ была построена небольшая теплица на 76 кв. м, организовано небольшое парниковое хозяйство в 36 парниковых рам, заложены некоторые отделы (овощной, полевой, питомник, цветочный).

С 1 ноября 1991 года Областная станция юных натуралистов была реорганизована в Эколого-биологический центр. С 1992 года начала работать областная экологическая школа.

С 2009 года Детский эколого-биологический центр стал экологическим отделом ЦДЮ. С этого же года на бывшем футбольном поле у стен Учреждения началась стройка теплицы, которая на данный момент работает в полную силу и радует прекрасными цветочно-декоративными растениями.

В 2023 году отмечается 105 лет Юннатскому движению, с которого и началась история отдела экологического образования!