С 1995 года в Центре была введена стипендия для наиболее отличившихся учащихся, показывающих высокие результаты на конкурсах, соревнованиях или фестивалях, успешно осваивающих программы по нескольким направлениям, активно участвующие в жизни Центра и занимающиеся в нем не менее двух лет.
Первыми стипендиатами были Марина Галочкина из Школы юного модельера «Стиль», Ирина Кирсанова из мастерской «Горница», сейчас она – педагог ЦДЮ, Елизавета Смирнова из хоровой студии «Аллегро» и Никита Насырин из эстрадно-джазовой студии «А&Б».
В последующие почти десять лет стипендия ежегодно назначалась от пяти до десяти лучшим учащимся – представителям разных коллективов Центра.
Еще одни стипендиаты – это обладатели ежемесячных губернаторских стипендий одаренным детям, которые с 2005 года назначаются ежегодно постановлением губернатора Ярославской области. Их получают те учащиеся, кто добился высоких результатов в культуре, образовании, спорте, техническом творчестве и являются победителями и призерами всероссийских, международных конкурсов, фестивалей, олимпиад, соревнований. В Центре таких стипендиатов за эти годы– более 20.
