Первым директором учреждения, при котором оно строилось и открывалось, а затем делало первые шаги был Лев Бородин, заслуженный работник культуры России. Он руководил учреждением с 1969 по 1982. Про харизматичного, с хорошим чувством юмора, энергичного и обаятельного директора даже ходила присказка «Лев Борисыч Бородин – на все Брагино один!».
На посту директора Льва Борисовича сменила Людмила Косоурихина, заслуженный учитель РФ, которая проработала на этой должности с марта 1982 по январь 1990 года. В дальнейшем Людмила Михайловна работала методистом учреждения, воспитала не одно поколение педагогов и пользовалась большим авторитетом среди коллег всей области.
С марта 1991 по февраль 2003 года Центр возглавляла Ангелина Золотарева. Сейчас Ангелина Викторовна – известный российский ученый, доктор педагогических наук, профессор, член-корреспондент Российской академии образования.
После ее перехода в Ярославский педагогический университет пост директора с февраля 2003 по май 2013 занимал Юрий Пузанов. Ныне – руководитель спортивного клуба «Ареналь», почетный работник общего образования РФ. Юрий Валентинович – выпускник нашего Центра.
С сентября 2013 по ноябрь 2018 года Центром руководила Людмила Фомина, кандидат психологических наук, почетный работник общего образования РФ. С деятельностью Людмилы Владимировны связан переход учреждения в статус автономного.
С февраля 2019 года директором Центра является Елена Дубовик. Елена Анатольевна, почетный работник общего образования РФ, обладатель Почётного знака Алексея Петровича Мельгунова, выпускница Центра детей и юношества.
